作为浙江大学医学院临床医学三系，医院目前有15个博士点和28个硕士点。设有26个临床教学教研室，每年承担二百余名在培硕士、博士及博士后研究生的临床教学和科研培训任务。
近年来，医院在科研和学科建设上的投入不断加大，使医院的科研实力显著增强，凝练出三大重点研究方向：生物治疗、微创医学、再生医学（组织工程）。医院拥有浙江大学邵逸夫临床研究所、浙江大学微创外科研究所、浙江省肿瘤生物治疗重点实验室和浙江省腔镜技术研究重点实验室四大研究机构，建立了与国际接轨的研究开发平台，形成了良好的科研氛围。医院连续数年获得几十项国家自然科学基金，并有多项国家科技部支撑项目、863项目及卫生部行业基金项目，多位学科带头人获得国家级及省部级科技进步奖。
医院在十八年的发展历程中，不仅在管理上形成了自己的特色和亮点，并且在国际合作与交流方面成为国内同行学习的典范。美国罗马琳达大学医学中心是邵逸夫医院的长期合作伙伴，他们在邵逸夫医院不同成长历程中给予了全方位的支持和帮助，截止2012年，罗马琳达大学已派遣1200名专家来邵逸夫医院帮助开展工作，邵逸夫医院派遣去罗马琳达进行观摩和临床技能培训的员工已达260多名。在与罗马琳达大学合作不断深入的同时，医院还与国外多个顶尖医疗机构建立了交流和合作关系，分别为美国John Hopkins医院、美国辛辛那提大学、美国密歇根州Genesys医学中心、澳大利亚皇家外科学院、澳大利亚Alfred医院、瑞士Zurich大学、澳大利亚Cabrini医疗集团和日本静冈综合病院等医疗机构。国际合作广度与深度的不断推进，使医院建立了多个国际化的医疗中心运作平台，相继成立牙种植中心、中美联合“头颈颌面肿瘤中心”、中澳急、慢性疼痛管理中心，国际化医疗中心的建立，有利于医院以疾病为中心的多学科综合性一体化治疗模式得以深入推广。
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