安徽医科大学第一附属医院是安徽省规模较大的综合性教学医院，集医疗、教学、科研、预防、康复、急救为一体。前身为上海东南医学院附属东南医院，创办于1926年。1949年内迁至安徽怀远县，1952年迁至合肥市。1993年成为卫生部首批三级甲等医院。2011年进入中国较佳医院80强排行榜。
医院拥有博士生导师51人，副高职称以上专家660余人，博士和在读博士200余人，硕士380余人，享受国务院和省政府特殊津贴120人，担任省级以上医学学术团体负责人60多人，有7人入选全国"百千万人才工程"，6人被国家人事部、卫生部授予“有突出贡献的中青年专家”，省厅以上跨世纪学术技术带头人、骨干教师100余人，人才实力位居安徽省医疗机构第一。
医院坚持科教兴院战略，学科技术水平不断取得新的突破，银屑病的遗传学研究和红斑狼疮基因研究处于国际领先水平，同种异体肝脏移植、自体干细胞移植、异体干细胞移植、异体肾脏移植、体外循环、心脏不停跳冠脉搭桥、心脑血管介入治疗、胸腔镜和腹腔镜微创手术、辅助生殖技术、小儿脑瘫治疗等专业技术水平处国内先进水平。在中西医结合治疗大面积烧伤、微粒皮移植、眼角膜移植、人工晶体植入术等方面积累了丰富的经验,处省内领先地位。
医院是卫生部心血管疾病介入诊疗培训基地、卫生部腹膜透析培训示范中心、卫生部临床药师培训基地、卫生部脑卒中筛查培训基地、卫生部全科医师培训基地、卫生部四级妇科内镜手术培训基地培育单位。临床医学为国家级特色专业建设点，省级教学团队2个，4人获安徽省教育名师奖。医院每年承担国家级和省级继续教育项目50余项，培训学员万余人。
近年来，医院承担国家863计划和973计划、国家自然科学基金、安徽省自然科学基金等科研课题200余项，获省部级以上奖项55余项，其中获国家科技进步二等奖1项，教育部自然科学一等奖1项，连续两年获中华医学科技一等奖。每年发表学术论文1100余篇，其中SCI收录论文120余篇，主编和参编国家级规划教材20余部。主办5种国内外公开发行杂志：《肝胆外科杂志》、《临床骨科杂志》、《临床眼科杂志》、《临床护理杂志》、《临床肺科杂志》。医院与美国、荷兰、德国、日本、香港等国家和地区的科学研究机构建立了密切的科研合作关系。
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