中国医学科学院皮肤病研究所1954年创建于北京，直属中央卫生部领导。1970年从北京迁至江苏泰州，1984年迁南京现址，并建立皮肤病医院。1986年设立全国性病防治研究中心，2005年调整为中国疾病预防控制中心性病控制中心、中国疾病预防控制中心麻风病控制中心。
该院所是我国较早成立的从事皮肤病、性病、麻风病，集临床、科研、防治和教学为一体的国家级专业机构。为世界卫生组织性传播疾病预防与控制合作中心、皮肤性病学国家重点学科、博士和硕士学位授予点、国家药品临床研究基地、中国微生物菌种保藏管理委员会医学真菌中心、江苏省临床医学中心、卫生部化妆品皮肤病诊断机构、中国医学科学院艾滋病研究中心性传播疾病控制中心、家庭健康国际中国合作中心，同时承担《中华皮肤科杂志》、《国际皮肤性病学杂志》的编辑和出版任务。
该院所占地4.04万平方米，建筑面积3.6万平方米，主要建筑有门诊楼、病房楼、医技楼、科研楼、教育防治业务楼、SPF级实验动物中心。医院编制床位100张，设有20多个临床、科研科室，年接诊病员约60万人次。300余名在职职工中，高级专家62名，博士生导师9名，硕士生导师23名，享受政府特殊津贴专家17名。50余名专家在国家及省级专业委员会任职。现有中青年骨干中，多人当选卫生部突出贡献专家、新世纪百千万国家级人选、江苏省“六大高峰”人才和医学重点人才。
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